| Platz | Spieler | Mannschaft | Tore | Elfmeter |
|---|---|---|---|---|
| 1. | Marek Mintál | 1. FC Nürnberg | 18 | 0 |
| 1. | Francisco Copado | SpVgg Unterhaching | 18 | 3 |
| 3. | Petr Ruman | SpVgg Greuther Fürth | 16 | 0 |
| 4. | Conor Casey | Karlsruher SC | 14 | 0 |
| 4. | Ferydoon Zandi | VfB Lübeck | 14 | 2 |
| 4. | Abdelaziz Ahanfouf | MSV Duisburg | 14 | 1 |
| 4. | Isaac Boakye | Arminia Bielefeld | 14 | 1 |
| 8. | Marcus Feinbier | SpVgg Greuther Fürth | 13 | 0 |
| 8. | Michael Thurk | 1. FSV Mainz 05 | 13 | 1 |
| 8. | Steffen Baumgart | 1. FC Union Berlin | 13 | 2 |
| 11. | Marcel Schied | VfL Osnabrück | 12 | 0 |
| 11. | Jacek Krzynowek | 1. FC Nürnberg | 12 | 2 |
| 13. | Markus Kurth | MSV Duisburg | 11 | 0 |
| 13. | Catalin Racanel | Eintracht Trier | 11 | 0 |
| 15. | Nico Patschinski | Eintracht Trier | 10 | 2 |
| 15. | Róbert Vittek | 1. FC Nürnberg | 10 | 0 |
| 17. | Iwan Sajenko | Karlsruher SC | 9 | 0 |
| 17. | Stefan Reisinger | SV Wacker Burghausen | 9 | 0 |
| 17. | Alexander Bugera | MSV Duisburg | 9 | 4 |
| 17. | Laurentiu Reghecampf | Energie Cottbus | 9 | 1 |
| 17. | Saša Ćirić | 1. FC Nürnberg | 9 | 0 |
| 17. | Santiago Silva | Energie Cottbus | 9 | 0 |
| 23. | Jens Scharping | VfB Lübeck | 8 | 0 |
| 23. | Salif Keita | 1. FC Union Berlin | 8 | 0 |
| 23. | Emmanuel Krontiris | Alemannia Aachen | 8 | 0 |
| 23. | Saša Radulović | Rot-Weiß Oberhausen | 8 | 0 |
| 23. | Stefan Blank | Alemannia Aachen | 8 | 2 |
| 23. | Chwitscha Schubitidse | Erzgebirge Aue | 8 | 0 |
| 23. | Andrzej Juskowiak | Erzgebirge Aue | 8 | 0 |
| 30. | Bojko Welitschkow | Rot-Weiß Oberhausen | 7 | 1 |
| 30. | Goran Šukalo | SpVgg Unterhaching | 7 | 0 |
| 30. | Sascha Rösler | SpVgg Greuther Fürth | 7 | 1 |
| 30. | Marco Küntzel | Arminia Bielefeld | 7 | 0 |
| 30. | Danny Winkler | Eintracht Trier | 7 | 1 |
| 30. | Ivica Grlić | Alemannia Aachen | 7 | 3 |
| 30. | Thomas Sobotzik | 1. FC Union Berlin | 7 | 0 |
| 37. | Erik Meijer | Alemannia Aachen | 6 | 0 |
| 37. | Adrian Aliaj | Rot-Weiß Oberhausen | 6 | 2 |
| 37. | Massimilian Porcello | Arminia Bielefeld | 6 | 0 |
| 37. | Željko Sopić | Rot Weiss Ahlen | 6 | 0 |
| 37. | Alassane Ouedraogo | Rot-Weiß Oberhausen | 6 | 0 |
| 37. | Leandro Simioni | Rot-Weiß Oberhausen | 6 | 0 |
| 37. | Karsten Hutwelker | Jahn Regensburg | 6 | 0 |
| 37. | Christian Lenze | VfL Osnabrück | 6 | 1 |
| 37. | Matthias Keller | Eintracht Trier | 6 | 0 |
| 37. | Gregg Berhalter | Energie Cottbus | 6 | 0 |
| 37. | Youssef Mokhtari | SV Wacker Burghausen | 6 | 0 |
| 37. | Fatmir Vata | Arminia Bielefeld | 6 | 0 |
| 49. | Skerdilaid Curri | Erzgebirge Aue | 5 | 0 |
| 49. | Benjamin Auer | 1. FSV Mainz 05 | 5 | 0 |