| Platz | Spieler | Mannschaft | Tore | Elfmeter |
|---|---|---|---|---|
| 1. | Régis Dorn | SV Sandhausen | 22 | 0 |
| 2. | Moritz Hartmann | FC Ingolstadt | 21 | 0 |
| 3. | Orlando Smeekes | FC Carl Zeiss Jena | 17 | 1 |
| 4. | Dennis Kruppke | Eintracht Braunschweig | 16 | 5 |
| 5. | Andreas Spann | 1. FC Heidenheim | 15 | 0 |
| 6. | Michael Holt | Holstein Kiel | 14 | 1 |
| 6. | Tobias Schweinsteiger | SpVgg Unterhaching | 14 | 4 |
| 6. | Sven Schipplock | VfB Stuttgart II | 14 | 0 |
| 9. | Carsten Kammlott | FC Rot-Weiß Erfurt | 13 | 0 |
| 10. | Saër Sène | Bayern München II | 12 | 0 |
| 10. | Mehmet Ekici | Bayern München II | 12 | 4 |
| 10. | Halil Savran | Dynamo Dresden | 12 | 3 |
| 10. | Stefan Leitl | FC Ingolstadt | 12 | 8 |
| 14. | Mirnes Mesic | Kickers Offenbach | 11 | 2 |
| 14. | Najeh Braham | Erzgebirge Aue | 11 | 2 |
| 14. | Eric Agyemang | Erzgebirge Aue | 11 | 2 |
| 14. | Patrick Mayer | 1. FC Heidenheim | 11 | 0 |
| 14. | Deniz Yılmaz | Bayern München II | 11 | 2 |
| 14. | Björn Lindemann | VfL Osnabrück | 11 | 0 |
| 20. | Sebastian Glasner | Erzgebirge Aue | 10 | 0 |
| 20. | Onur Ayik | SV Werder Bremen II | 10 | 0 |
| 20. | Thomas Rathgeber | SpVgg Unterhaching | 10 | 0 |
| 20. | Kingsley Onuegbu | Eintracht Braunschweig | 10 | 0 |
| 24. | Thiago Rockenbach | FC Rot-Weiß Erfurt | 9 | 4 |
| 24. | Christian Cappek | SV Wacker Burghausen | 9 | 0 |
| 26. | Bastian Heidenfelder | 1. FC Heidenheim | 8 | 0 |
| 26. | Marco Calamita | Eintracht Braunschweig | 8 | 0 |
| 26. | David Ulm | Kickers Offenbach | 8 | 0 |
| 26. | Stefan Zinnow | Kickers Offenbach | 8 | 0 |
| 26. | Pascal Testroet | SV Werder Bremen II | 8 | 0 |
| 26. | Daniel Sikorski | Bayern München II | 8 | 0 |
| 26. | Sebastian Hähnge | FC Carl Zeiss Jena | 8 | 0 |
| 33. | Aykut Öztürk | SV Wehen Wiesbaden | 7 | 0 |
| 33. | Richard Weil | 1. FC Heidenheim | 7 | 5 |
| 33. | Tobias Damm | Wuppertaler SV | 7 | 0 |
| 33. | Petr Stoilov | Jahn Regensburg | 7 | 0 |
| 33. | Marcel Ziemer | SV Wehen Wiesbaden | 7 | 1 |
| 33. | Aleksandar Kotuljac | VfL Osnabrück | 7 | 0 |
| 33. | Tino Semmer | FC Rot-Weiß Erfurt | 7 | 0 |
| 33. | Marcus Steegmann | SpVgg Unterhaching | 7 | 0 |
| 41. | Dennis Schmidt | VfL Osnabrück | 6 | 1 |
| 41. | Tim Wulff | Holstein Kiel | 6 | 0 |
| 41. | Steffen Bohl | SV Wehen Wiesbaden | 6 | 0 |
| 41. | Björn Ziegenbein | SV Wehen Wiesbaden | 6 | 3 |
| 41. | Fikri El Haj Ali | SV Wacker Burghausen | 6 | 0 |
| 41. | Sebastian Hille | Borussia Dortmund II | 6 | 0 |
| 41. | Uwe Hünemeier | Borussia Dortmund II | 6 | 2 |
| 41. | Sreto Ristic | SV Sandhausen | 6 | 0 |
| 41. | Daniel Ginczek | Borussia Dortmund II | 6 | 0 |
| 41. | Sebastian Reinert | SV Wehen Wiesbaden | 6 | 1 |